Предлагаю интегрировать ваше приложение с Web-браузером, чтобы он получал доступ к ресурсам и накопителям компьютера.

Например что бы была возможность аутентификации к определенному веб-ресурсу с помощью флешки (благодаря программе Rohos Logon Key), тем самім заменяя смарт-карты или USB-токены к примеру